Sobre las aves de las expediciones Santander-Bio, cuantificando el costo de colectar especímenes en Colombia / On birds of santander-bio expeditions, quantifying the cost of collecting voucher specimens in colombia

ABSTRACT Several scientific reasons support continuing bird collection in Colombia, a megadiverse country with modest science financing. Despite the recognized value of biological collections for the rigorous study of biodiversity, there is scarce information on the monetary costs of specimens. We present results for three expeditions conducted in Santander (municipalities of Cimitarra, El Carmen de Chucurí, and Santa Barbara), Colombia, during 2018 to collect bird voucher specimens, quantifying the costs of obtaining such material. After a sampling effort of 1290 mist net hours and occasional collection using an airgun, we collected 300 bird voucher specimens, representing 117 species from 30 families. Such collection represents one of the largest series obtained during the historical ornithological exploration of Santander. We report differences among expeditions regarding the capture rate in mist nets, as well as differences in the sizes of taxa collected by mist nets and airgun. We discuss results in the context of previous ornithological expeditions in Colombia, commenting issues on the biology of some species, particularly those considered as noteworthy records (e.g., Red-legged Tinamou [Crypturellus erythropus], Cinnamon Screech Owl [Megascopspetersoni], Saffron-headed Parrot [Pyriliapyrilia], Black Inca [Coeligena prunellei], and Chestnut-crowned Gnateater [Conopophaga castaneiceps]). We calculated that the costs of obtaining and curating a specimen in Colombia, including tissues for molecular analysis, was ~US$60.4 (~$196 176 COP), which is among published costs of obtaining voucher specimens in other taxa and countries. These costs must be considered an investment in scientific capital because voucher specimens will provide biological information for hundreds of years.

RESUMEN Hay distintas razones científicas que apoyan la recolección de aves en Colombia, un país megadiverso pero con una modesta inversión en ciencia. Pese al valor de las colecciones biológicas para el estudio riguroso de la biodiversidad, la información sobre costos monetarios de recolectar especímenes es escasa. Presentamos resultados de la cuantificación del costo de obtener especímenes de aves durante tres expediciones en Santander (municipios de Cimitarra, El Carmen de Chucurí y Santa Bárbara), Colombia, en 2018. Tras un esfuerzo de muestreo de 1290 horas/red y recolecta ocasional con una pistola de aire, obtuvimos 300 especímenes pertenecientes a 117 especies de 30 familias, una de las series más grandes de la historia de la exploración ornitológica del departamento de Santander. Reportamos diferencias entre expediciones en cuanto a la tasa de captura con redes de niebla, así como diferencias en los tamaños de los taxones recolectados mediante redes de niebla y pistola de aire. Discutimos los resultados en el contexto de otras expediciones ornitológicas en Colombia, comentando algunos aspectos de la biología de especies relevantes (e.g., Crypturellus erythropus, Megascops petersoni, Pyrilia pyrilia, Coeligena prunellei y Conopophaga castaneiceps). El costo que calculamos para obtener y curar un espécimen, incluyendo tejidos para análisis moleculares futuros, es de ~$60,4 dólares estadounidenses (~$196 176 pesos colombianos), costo que se encuentra dentro del rango para obtener especímenes de otros taxones en otros países. Estos costos deben considerarse como una inversión al capital científico, debido a que los especímenes brindarán información biológica por cientos de años.

Colombian froze biodiversity: 16 years of the tissue collection of the humboldt intiitute / La biodiversidad congelada de Colombia: 16 años de la colección de tejidos del Instituto Humboldt

Collections of frozen tissue samples stand as keystone sources of molecular information to construct biodiversity knowledge, and are particularly challenged if they focus on megadiverse countries. In 1998 the Humboldt Institute (Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt) began a tissue collection of Colombian biodiversity (IAvH-CT) and the aim of this work is to present a diagnostic and an historical perspective for that collection, constructed by compiling information and experiences on its management as well as by organizing and curating the information of each catalogued sample. After 16 years, the IAvH-CT harbors 16,469 samples, which represent around 2530 species from 1289 genera, and 323 families of the Colombian biodiversity. Samples are biased toward plants (44 %) and birds (40 %), but also include other animal taxa. Geographically, IAvH-CT includes samples from all Colombian departments, but there is broad variation in their coverage. When compared with other international collections, IAvH-CT fulfills several standards of sample storage and data management, but its major weakness is that several tissues seem to lack a vouchered specimen. Tissues housed at IAvH-CT have been included in at least 48 studies published in several scientific journals. IAvH-CT is implementing strategies to improve curatorial standards, fill-in taxonomic gaps, and to explore the potential of its samples to understand the outstanding Colombian biota in a cooperative research framework among institutions.

Las colecciones de tejidos son fuentes fundamentales de información molecular para el conocimiento de la biodiversidad, y son particularmente desafiantes si están enfocadas en países megadiversos. En 1998 el Instituto Humboldt (Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt) inició una colección de tejidos de la biodiversidad colombiana (IAvH-CT). El objetivo de este trabajo es presentar un diagnóstico y una perspectiva histórica de esta colección, mediante la compilación de información y de experiencias sobre su manejo y organizando y curando la información de cada muestra catalogada. Después de 16 años IAvH-CT resguarda 16,469 muestras, que representan alrededor de 2530 especies de 1289 géneros y 323 familias de la biodiversidad colombiana. El número de muestras está sesgado hacia plantas (44 %) y aves (40 %), pero también incluyen otros taxones animales. Geográficamente, IAvH-CT incluye muestras de todos los departamentos colombianos, pero hay una gran variación en su cobertura. Al ser comparada con otras colecciones internacionales se encuentra que IAvH-CT cumple varios estándares de almacenamiento de muestras y de manejo de datos, pero su gran debilidad es que varios tejidos aparentemente carecen de un ejemplar de referencia. Varios tejidos almacenados en IAvH-CT han sido incluidos en al menos 48 estudios publicados en varias revistas científicas. IAvH-CT está implementando estrategias para mejorar la curaduría, llenar vacíos taxonómicos y explorar el potencial de sus muestras para entender la impresionante biota colombiana en un marco de investigación en cooperación con otras instituciones.

Patrones de la oomposición de aves acuáticas enel río la vieja, valle geográfiico del río cauca, Colombia / Composition Patterns of Waterbirds from La Vieja River, Geographic Valley of Cauca River, Colombia

Compilamos y analizamos los datos de observaciones realizadas entre los años 2001 y 2013 en tres sectores a lo largo del cauce del río La Vieja, ubicado en el valle geográfico del río Cauca, Colombia. Describimos los datos espacial y temporalmente, enfocándonos en identificar patrones de composición y abundancia de especies. Registramos 28 especies de aves acuáticas en 33 transectos, siendo 22 especies observadas en más del 50 % de los transectos. Las diferencias en el número de especies por transecto no fueron significativas entre los tres sectores del río. Sin embargo, dos análisis de agrupamiento, considerando tanto los datos de presencia/ausencia como de abundancia, indicaron que la composición de especies presenta estructura espacial a lo largo del río. En contraste, aunque las observaciones se realizaron durante más de diez años no se encontró evidencia de cambios temporales en la composición de especies. No obstante, algunas especies mostraron tendencias de aumento o disminución en su frecuencia. Presentamos el nuevo registro de una especie (Chloroceryle aenea) para la región. A pesar de que el paisaje asociado al río La Vieja ha sufrido un gran impacto antropogénico, aún conserva una diversidad significativa de aves acuáticas que pueden servir para aportar valor a los planes de conservación en la zona.

We compiled and analyzed data gathered from observations during the period 2001-2013 in three sectors along La Vieja river, located in the Cauca river valley, Colombia. We describe spatial and temporal aspects of such dataset, focusing in indentify patterns of species' composition and abundance. We recorded 28 waterbird species in 33 transects, being 22 species observed in more than 50 % of these transects. The species richness among transects did not shows significant differences. However, two cluster analyses, considering both presence/absence and abundance data, showed that there is spatial structure in the species composition along the river. In contrast, although observations were conducted during more than ten years there is no evidence of temporal changes in species composition. Still, some species showed increase or decrease trends in their frequency. We present a new record for one species (Chloroceryle aenea) for the region. Despite that the landscape surrounding La Vieja river have faced a high anthropogenic impact, the river still presents a significant diversity of waterbirds, which could add value to the conservation plans in the zone.

Filogeografía cmmparada: conceptos, métodos y patrones generales en aves neotropicaess / Comparative Phylogeography: Concepts, Methods and General Patterns in Neotropical Birds

Entender los patrones y procesos de diversificación de linajes intraespecíficos en el tiempo y en el espacio es el objetivo de la filogeografía. La comparación de estos patrones filogeográficos entre especies co-distribuidas muestra indicios de la historia de una comunidad. Aquí, reviso los conceptos y la metodología de la filogeografía comparada, un campo muy activo pero con métodos de análisis heterogéneos. Para dar un marco de referencia de la filogeografía en el Neotrópico, comento los patrones filogeográficos generales de las aves de esta región. La revisión de más de 100 estudios realizados en los últimos 25 años indica que los patrones filogeográficos de cada especie a pesar de coincidir en ciertos puntos con el de otras especies co-distribuidas tienen aspectos idiosincrásicos que indican que su historia es única.

Understanding the patterns and processes involved in intraspecific lineages diversification in time and space is the aim of phylogeography. The comparison of those phylogeographic patterns among co-distributed species shows insights of a community history. Here I review the concepts and methodologies of comparative phylogeography, an active research field that has heterogeneous analytical methods. In order to present a framework for phylogeography in the Neotropics, I comment the general phylogeographic patterns of the birds from this region. This review is based on more than 100 studies conducted during the last 25 years and indicate that despite different co-distributed species seem to share some points in their phylogeographic pattern they have idiosyncratic aspects, indicating an unique history for each one.